Factor de transcrición: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
m Bot: Cambio o modelo: Cite book; cambios estética
Liña 1:
En [[bioloxía molecular]] e en [[xenética]], un '''factor de transcrición''' (ás veces chamado factor de unión ao ADN específico de secuencia) é unha [[proteína]] que se une a [[secuencia de ADN|secuencias de ADN]] específicas, controlando deste modo o fluxo (ou a [[transcrición xenética|transcrición]]) de información xenética que vai do [[ADN]] ao [[ARN mensaxeiro]]. <ref name="pmid9570129">{{cite journal | author = Latchman DS | title = Transcription factors: an overview | journal = Int. J. Biochem. Cell Biol. | volume = 29 | issue = 12 | pages = 1305–12 | year = 1997 | pmid = 9570129 | doi = 10.1016/S1357-2725(97)00085-X }}</ref><ref name="pmid2128034">{{cite journal | author = Karin M | title = Too many transcription factors: positive and negative interactions | journal = New Biol. | volume = 2 | issue = 2 | pages = 126–31 | year = 1990 | pmid = 2128034 | doi = }}</ref> Os factores de transcrición realizan esta función sós ou xunto con outras proteínas formando un complexo, promovendo (funcionando como un [[activador (xenética)|activador]]), ou bloqueando (como [[represor]]es) o recrutamento da [[ARN polimerase]] (o encima que realiza a [[transcrición xenética|transcrición]] da información xenética do [[ADN]] ao [[ARN]]) en [[xene]]s específicos. <ref name="pmid8870495">{{cite journal | author = Roeder RG | title = The role of general initiation factors in transcription by RNA polymerase II | journal = Trends Biochem. Sci. | volume = 21 | issue = 9 | pages = 327–35 | year = 1996 | pmid = 8870495 | doi = 10.1016/0968-0004(96)10050-5 }}</ref><ref name="pmid8990153">{{cite journal | author = Nikolov DB, Burley SK | title = RNA polymerase II transcription initiation: A structural view | journal = Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. | volume = 94 | issue = 1 | pages = 15–22 | year = 1997 | pmid = 8990153 | doi = 10.1073/pnas.94.1.15 | pmc = 33652 }}</ref><ref name="pmid11092823">{{cite journal | author = Lee TI, Young RA | title = Transcription of eukaryotic protein-coding genes | journal = Annu. Rev. Genet. | volume = 34 | issue = | pages = 77–137 | year = 2000 | pmid = 11092823 | doi = 10.1146/annurev.genet.34.1.77}}</ref>
 
Unha característica definitoria dos factores de transcrición é que conteñen un ou máis [[dominio de unión ao ADN|dominios de unión ao ADN]], que se unen a secuencias específicas do ADN adxacentes aos xenes que regulan. <ref name="pmid2667136">{{cite journal | author = Mitchell PJ, Tjian R | title = Transcriptional regulation in mammalian cells by sequence-specific DNA binding proteins | journal = Science | volume = 245 | issue = 4916 | pages = 371–8 | year = 1989 | pmid = 2667136 | doi = 10.1126/science.2667136 }}</ref><ref name="pmid9121580">{{cite journal | author = Ptashne M, Gann A | title = Transcriptional activation by recruitment | journal = Nature | volume = 386 | issue = 6625 | pages = 569–77 | year = 1997 | pmid = 9121580 | doi = 10.1038/386569a0 }}</ref> Outras proteínas como os [[coactivador (xenética)|coactivadorcoactivadores]]es, [[complexo remodelador da estrutura da cromatina|complexos remodeladores da cromatina]], [[histona acetilase]]s, [[histona desacetilase]]s, [[quinase]]s, e [[metilase]]s, tamén desempeñan papeis cruciais na [[regulación da expresión xénica]], pero carecen de dominios de unión ao ADN e, por esa razón, non se clasifican como factores de transcrición. <ref name="pmid11823631">{{cite journal | author = Brivanlou AH, Darnell JE | title = Signal transduction and the control of gene expression | journal = Science | volume = 295 | issue = 5556 | pages = 813–8 | year = 2002 | pmid = 11823631 | doi = 10.1126/science.1066355 }}</ref>
 
== Conservación en diferentes organismos ==
Liña 23:
=== Regulación da transcrición basal ===
 
Nos [[eukarya|eucariotaeucariotas]]s, son necesarios unha importante clase de factores de transcrición chamados [[factor de transcrición xeral|factores de transcrición xeral]] (GTFs) para que teña lugar a transcrición. <ref name="isbn1-86094-126-5">{{citeCita booklibro | author = Robert O. J. Weinzierl | authorlink = | editor = | others = | title = Mechanisms of Gene Expression: Structure, Function and Evolution of the Basal Transcriptional Machinery | edition = | publisher = World Scientific Publishing Company | location = | year = 1999 | pages = | isbn = 1-86094-126-5 | oclc = | doi = | url = }}</ref><ref name="pmid12672487">{{cite journal | author = Reese JC | title = Basal transcription factors | journal = Current opinion in genetics & development | volume = 13 | issue = 2 | pages = 114–8 | year = 2003 | month = April | pmid = 12672487 | doi = 10.1016/S0959-437X(03)00013-3 | url = }}</ref><ref name="pmid12676794">{{cite journal | author = Shilatifard A, Conaway RC, Conaway JW | title = The RNA polymerase II elongation complex | journal = Annual review of biochemistry | volume = 72 | issue = | pages = 693–715 | year = 2003 | pmid = 12676794 | doi = 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161551 | url = }}</ref> Moitos destes factores de transcrición xeral non se unen realmente ao ADN senón que son parte dun [[complexo de preiniciación da transcrición]] grande que interacciona directamente coa [[ARN polimerase]]. Os factores de transcrición xeral máis comúns son: [[TFIIA]], [[TFIIB]], [[TFIID]] (ver tamén [[proteína de unión á TATA]]), [[TFIIE]], [[TFIIF]], e [[TFIIH]]. <ref name="pmid16858867">{{cite journal | author = Thomas MC, Chiang CM | title = The general transcription machinery and general cofactors | journal = Critical reviews in biochemistry and molecular biology | volume = 41 | issue = 3 | pages = 105–78 | year = 2006 | pmid = 16858867 | doi = 10.1080/10409230600648736| url = }}</ref> O complexo de preiniciación únese a rexións [[promotor (xenética)|promotoras]] do ADN ''[[corrente arriba]]'' (en dirección 5', ''[[upstream]]'') do xene que regulan.
 
=== Potenciación diferencial da transcrición ===
Liña 30:
==== Desenvolvemento ====
 
Moitos factores de transcrición nos organismos multicelulares están implicados no desenvolvemento. <ref name="pmid1424766">{{cite journal | author = Lobe CG | title = Transcription factors and mammalian development | journal = Current topics in developmental biology | volume = 27 | issue = | pages = 351–83 | year = 1992 | pmid = 1424766 | doi = 10.1016/S0070-2153(08)60539-6| url = | series = Current Topics in Developmental Biology | isbn = 978-0-12-153127-0 }}</ref> Respondendo a sinais (estímulos), estes factores de transcrición activan ou desactivan a transcrición dos xenes apropiados, o cal, á súa vez, permite que se produzan cambios na morfoloxía celular ou actividades necesarias para a determinación do destino da célula e a [[diferenciación celular]]. A familia de factores de transcrición [[Hox]], por exemplo, é importante para unha adecuada [[especificación rexional|formación do patrón corporal]] en organismos tan diversos como as moscas da froita e os humanos. <ref name="pmid17008523">{{cite journal | author = Lemons D, McGinnis W | title = Genomic evolution of Hox gene clusters | journal = Science | volume = 313 | issue = 5795 | pages = 1918–22 | year = 2006 | month = September | pmid = 17008523 | doi = 10.1126/science.1132040 | url = }}</ref><ref name="pmid16515781">{{cite journal | author = Moens CB, Selleri L | title = Hox cofactors in vertebrate development | journal = Developmental biology | volume = 291 | issue = 2 | pages = 193–206 | year = 2006 | month = March | pmid = 16515781 | doi = 10.1016/j.ydbio.2005.10.032 | url = }}</ref> Outro exemplo é o factor de transcrición codificado pola rexión determinante do sexo do cromosoma Y (xene [[SRY]]), que xoga un papel principal na determinación do sexo nos humanos. <ref name="pmid17187356">{{cite journal | author = Ottolenghi C, Uda M, Crisponi L, Omari S, Cao A, Forabosco A, Schlessinger D | title = Determination and stability of sex | journal = BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology | volume = 29 | issue = 1 | pages = 15–25 | year = 2007 | month = January | pmid = 17187356 | doi = 10.1002/bies.20515 | url = }}</ref>
 
==== Resposta a sinais intercelulares ====
Liña 60:
=== Localización nuclear ===
 
Nos eucariotas, os factores de transcrición, igual que a maioría das proteínas (unhas poucas transcríbense nas mitocondrias e cloroplastos), transcríbense no [[núcleo celular]], pero son despois traducidas no [[citoplasma]]. Moitas proteínas que son activas no núcleo conteñen un [[sinal de localización nuclear]] que serve para dirixilas ao núcleo. Para moitos factores de transcrición este é un punto chave na súa regulación. <ref name="pmid8314906">{{cite journal | author = Whiteside ST, Goodbourn S | title = Signal transduction and nuclear targeting: regulation of transcription factor activity by subcellular localisation | journal = Journal of Cell Science | volume = 104 | issue =4 | pages = 949–55 | year = 1993 | month = April | pmid = 8314906 | doi = }}</ref> Importantes clases de factores de transcrición, como os [[receptor nuclear|receptores nucleares]] deben unirse primeiro a un [[ligando]] mentres están no citoplasma, para despois poder ser desprazados ao núcleo. <ref name="pmid8314906"/>
 
=== Activación ===
Liña 71:
=== Accesibilidade ao sitio de unión ao ADN ===
 
Nos eucariotas, o ADN está organizado xunto con proteínas [[histona]]s formando partículas compactas, chamadas [[nucleosoma]]s, nas que arredor de 147 [[par de bases|pares de bases]] do ADN dan dúas voltas arredor dun octámero central de histonas. O ADN dos nucleosomas é inaccesible para moitos factores de transcrición. Algúns factores de transcrición, denominados [[factor pioneiro|factores pioneiros]] poden malia todo unirse aos seus sitios de unión ao ADN no ADN nucleosómico. Para a maioría dos outros factores de transcrición, o nucleosoma debe ser activamente retirado por motores moleculares como os [[remodelación da cromatina|remodeladores da cromatina]]. <ref>{{cite journal |author=Teif V.B., Rippe K. |title=Predicting nucleosome positions on the DNA: combining intrinsic sequence preferences and remodeler activities |journal=Nucleic Acids Research|volume=37|issue=17|pages=5641–55|year=2009 |pmid=19625488 |pmc=2761276|doi=10.1093/nar/gkp610}}</ref> Alternativamente, o nucleosoma pode ser parcialmente desenrolado por flutuacións térmicas que permiten un acceso temporal ao sitio de unión do factor de transcrición. En moitos casos os factores de transcrición deben [[inhibición encimática|competir para unirse]] ao seu sitio de unión ao ADN con outros factores de transcrición e proteínas cromatínicas histonas e non histonas. <ref>{{cite journal |author=Teif V.B., Rippe K. |title=Statistical-mechanical lattice models for protein-DNA binding in chromatin |journal=Journal of Physics: Condensed Matter|year=2010|arxiv=1004.5514 |bibcode=2010JPCM...22O4105T |last2=Rippe |volume=22 |pages=4105 |doi=10.1088/0953-8984/22/41/414105 |issue=41}}</ref> Pares de factores de transcrición e outras proteínas poden ter papeis antagonistas (activador contra represor) na regulación dun mesmo [[xene]].
 
=== Dispoñibilidade doutros cofactores/factores de transcrición ===
Liña 81:
 
Os factores de transcrición teñen unha estrutura modular e conteñen os seguintes [[dominio proteico|dominios]]:<ref name="pmid9570129" />
* '''[[Dominio de unión ao ADN]]''' ('''DBD'''), que se une a secuencias específicas do ADN, chamadas [[amplificador (xenética)|amplificadores]] (''enhancers'') ou [[promotor (bioloxía)|promotores]], que son adxacentes aos xenes regulados. As secuencias do ADN ás que se unen os factores de transcrición denomínanse a miúdo [[elemento de resposta a hormonas|'''elementos de resposta''']].
* '''Dominio de transactivación''' ('''TAD'''), que contén sitios de unión para outras proteínas como os [[corregulador da transcrición|correguladores da transcrición]]. Estes sitios de unión denomínanse frecuentemente '''funcións de activación''' ('''AFs''').<ref name="pmid12893880">{{cite journal | author = Wärnmark A, Treuter E, Wright AP, Gustafsson J-Å | title = Activation functions 1 and 2 of nuclear receptors: molecular strategies for transcriptional activation | journal = Mol. Endocrinol. | volume = 17 | issue = 10 | pages = 1901–9 | year = 2003 | pmid = 12893880 | doi = 10.1210/me.2002-0384 }}</ref>
* Un '''dominio sensible ao sinal''' opcional ('''SSD''') (por exemplo, un dominio de unión a un [[ligando]]), que é sensible a sinais externos e, en resposta a eles transmite estes sinais ao resto do complexo de transcrición, causando un aumento ou diminución da expresión do xene. Ademais, o dominio de unión ao ADN e os dominios sensible ao sinal poden encontrarse en proteínas separadas que se asocian ao complexo de transcrición para regular así a [[expresión xénica]].
 
=== Dominio de transactivación ===
Liña 212:
Os factores de transcrición son importantes en medicina por dúas razóns: (1) as mutacións nestes factores poden ser asociados con determinadas enfermidades, e (2) os factores poden ser a diana de certos medicamentos.
 
=== Trastornos ===
 
Algunhas doenzas humanas están asociadas a mutacións nos factores de transcrición, debido aos seus importantes papeis no [[desenvolvemento]], [[sinalización celular|sinalización intercelular]], e [[ciclo celular]]. <ref name="isbn0-19-511239-3">{{citeCita booklibro | author = Semenza, Gregg L. | authorlink = | editor = | others = | title = Transcription factors and human disease | edition = | publisher = Oxford University Press | location = Oxford [Oxfordshire] | year = 1999 | pages = | isbn = 0-19-511239-3 | oclc = | doi = | url = }}</ref>
 
Moitos factores de transcrición son [[supresor de tumores|supresores de tumores]] ou [[oncoxene]]s, e, as mutacións ou a regulación anormal neles está asociada co [[cancro]]. Coñécense tres grupos de factores de transcrición que son importantes no cancro humano: (1) as familias [[NF-kappaB]] e [[factor de transcrición AP-1|AP-1]], (2) a familia [[proteína STAT|STAT]] e (3) os [[receptor de hormonas esteroides|receptores de hormonas esteroides]]. <ref name="pmid16475943">{{cite journal | author = Libermann TA, Zerbini LF | title = Targeting transcription factors for cancer gene therapy | journal = Curr Gene Ther | volume = 6 | issue = 1 | pages = 17–33 | year = 2006 | month = February | pmid = 16475943 | doi = 10.2174/156652306775515501| url = }}</ref>
Liña 261:
== Análise ==
 
Hai diferentes tecnoloxías aplicables para a análise de factores de transcrición. No nivel xenómico, utilízanse comunmente a [[secuenciación do ADN]] <ref>[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez EntrezGene database]</ref> e a investigación de bases de datos. A versión proteica concreta do factor de transcrición pode detectarse utilizando [[anticorpo]]s específicos. A mostra detéctase coa técnica da [[western blot]]. Utilizando o [[ensaio de cambio da mobilidade electroforética]] (EMSA),<ref name="pmid:18591661">{{cite journal | doi = 10.1073/pnas.0802130105 | author = Wenta N, Strauss H, Meyer S, Vinkemeier U | title = Tyrosine phosphorylation regulates the partitioning of STAT1 between different dimer conformations | journal = Proc Natl Acad Sci U S A | volume = 105 | issue = 27 |pages = 9238–43 | year = 2008 | pmid = 18591661 | pmc = 2453697 }}</ref> pode detectarse o perfil de activación do factor de transcrición. Unha aproximación [[ensaio múltiplex|múltiplex]] para o estudo do perfil de activación é o sistema de chip TF no que poden detectarse varios factores de transcrición en paralelo. Esta tecnoloxía está baseada nas [[micromatriz de ADN|micromatrices de ADN]] (''microarrays''), que proporcionan a secuencia específica de unión ao ADN para o factor de transcrición na superficie da matriz. <ref name="pmid:18366759">{{cite journal | doi = 10.1186/1476-4598-7-27 | author = Sermeus A, Cosse JP, Crespin M, Mainfroid V, de Longueville F, Ninane N, Raes M, Remacle J, Michiels C | title = Hypoxia induces protection against etoposide-induced apoptosis: molecular profiling of changes in gene expression and transcription factor activity | journal = Mol Cancer | volume = 7 | pages = 27 | year = 2008 | pmid = 18366759 | pmc = 2330149 }}</ref>
 
== Clases ==
Liña 271:
Hai tres clases de factores de transcrición segundo o seu mecanismo de acción:
 
* '''[[Factor de transcrición xeral|Factores de transcrición xeral]]'''. Están implicados na formación dun [[complexo de preiniciación da transcrición|complexo de preiniciación]]. Os máis comúns son: [[TFIIA]], [[TFIIB]], [[TFIID]], [[TFIIE]], [[TFIIF]], e [[TFIIH]]. Son ubicuos e interaccionan coa rexión núcleo (''core'') do [[promotor (xenética)|promotor]] que rodea o sitio de inicio da transcrición de todos os [[xene de clase II|xenes de clase II]]. <ref name="pmidc">{{cite journal | author = Orphanides G, Lagrange T, Reinberg D | title = The general transcription factors of RNA polymerase II | journal = Genes Dev. | volume = 10 | issue = 21 |pages = 2657–83 | year = 1996 | pmid = 8946909 | doi = 10.1101/gad.10.21.2657 }}</ref>
* '''Factores de transcrición que actúan ''augas arriba'' (''upstream'')'''. Son proteínas que se unen ''[[augas arriba]]'' (en dirección 5') do sitio de iniciación e estimulan ou reprimen a transcrición. Son máis ou menos o mesmo ca os '''factores de transcrición específicos''', porque varían considerablemente segundo en que [[secuencia de recoñecemento]] están presentes na proximidade do xene. <ref name=boron125-126>{{citeCita booklibro |author=Walter F., PhD. Boron |title=Medical Physiology: A Cellular And Molecular Approaoch |publisher=Elsevier/Saunders |location= |year=2003 |pages=125–126 |isbn=1-4160-2328-3 |oclc= |doi=}}</ref>
 
{|class="wikitable"
Liña 325:
Os factores de transcrición clasifícanse con frecuencia baseándose na similaridade das súas secuencias e, por tanto, na [[estrutura terciaria]] dos seus dominios de unión ao ADN. Distínguense os seguintes grupos:<ref name="pmid15706513">{{cite journal | author = Stegmaier P, Kel AE, Wingender E | title = Systematic DNA-binding domain classification of transcription factors | journal = Genome informatics. International Conference on Genome Informatics | volume = 15 | issue = 2 | pages = 276–86 | year = 2004 | pmid = 15706513 | doi = | url = http://www.jsbi.org/journal/GIW04/GIW04F028.html }}</ref><ref name="pmid16381825">{{cite journal | author = Matys V, Kel-Margoulis OV, Fricke E, Liebich I, Land S, Barre-Dirrie A, Reuter I, Chekmenev D, Krull M, Hornischer K, Voss N, Stegmaier P, Lewicki-Potapov B, Saxel H, Kel AE, Wingender E | title = TRANSFAC® and its module TRANSCompel®: transcriptional gene regulation in eukaryotes | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 34 | issue = Database issue | pages = D108–10 | year = 2006 | pmid = 16381825 | pmc = 1347505 | doi = 10.1093/nar/gkj143 }}</ref><ref>{{cite web|title=TRANSFAC database|url=http://www.gene-regulation.com/pub/databases/transfac/cl.html|accessdate = 2007-08-05}}</ref>
 
* 1 Superclase: Dominios básicos
** 1.1 Clase: Factores [[cremalleira de leucina]] ([[dominio bZIP|bZIP]])
*** 1.1.1 Familia: compoñentes do tipo [[AP-1 (factor de transcrición)|AP-1]]; como ([[c-Fos]]/[[c-Jun]])
*** 1.1.2 Familia: [[CREB]]
*** 1.1.3 Familia: factores do tipo [[proteínas de unión ao amplificador CCAAT|C/EBP]]
*** 1.1.4 Familia: bZIP / [[PAR (factor de transcrición)|PAR]]
*** 1.1.5 Familia: Factores de unión á caixa G de plantas
*** 1.1.6 Familía: ZIP só
** 1.2 Clase: Factores hélice-bucle-hélice ([[bHLH]])
*** 1.2.1 Familia: Factores ubicuos (clase A)
*** 1.2.2 Familia: Factores de transcrición mioxénica ([[MyoD]])
*** 1.2.3 Familia: Achaete-Scute
*** 1.2.4 Familia: Tal/Twist/Atonal/Hen
** 1.3 Clase: factores hélice-bucle-hélice / cremalleira de leucina ([[factores de transcrición hélice-bucle-hélice básica cremalleira de leucina|bHLH-ZIP]])
*** 1.3.1 Familia: Factores ubicuos bHLH-ZIP, como USF ([[USF1]], [[USF2]]); SREBP ([[proteína de unión ao elemento regulatorio esterol|SREBP]])
*** 1.3.2 Familia: Factores que controlan o [[ciclo celular]], como [[Myc|c-Myc]]
** 1.4 Clase: NF-1
*** 1.4.1 Familia: NF-1 ([[NFIA|A]], [[NFIB (xene)|B]], [[NFIC (xene)|C]], [[NFIX|X]])
** 1.5 Clase: RF-X
*** 1.5.1 Familia: RF-X ([[RFX1|1]], [[RFX2|2]], [[RFX3|3]], [[RFX4|4]], [[RFX5|5]], [[RFXANK|ANK]])
** 1.6 Clase: bHSH
 
* 2 Superclase: dominios de unión ao ADN coordinadores de cinc
** 2.1 Clase: tipo [[dedo de cinc]] Cys4 do [[receptor nuclear]]
*** 2.1.1 Familia: [[receptor de hormonas esteroides|receptores de hormonas esteroides]]
*** 2.1.2 Familia: Factores de tipo [[receptor de hormonas tiroideas]]
** 2.2 Clase: diversos dedos de cinc Cys4
*** 2.2.1 Familia: [[factor de transcrición GATA|Factores GATA]]
** 2.3 Clase: Dominio dedo de cinc Cys2His2
*** 2.3.1 Familia: factores ubicuos, como [[TFIIIA]], [[factor de transcrición Sp1|Sp1]]
*** 2.3.2 Familia: Reguladores do ciclo celular / desenvolvemento, como [[Krüppel]]
*** 2.3.4 Familia: Factores grandes con propiedades de unión similares a NF-6B
** 2.4 Clase: clúster Cys6 cisteína-cinc
** 2.5 Clase: Dedos de cinc de composición alterna
 
* 3 Superclase: [[Hélice-xiro-hélice]]
** 3.1 Clase: [[Homeobox|Dominio homeo]]
*** 3.1.1 Familia: Dominio homeo só, como [[Ubx]]
*** 3.1.2 Familia: Factores con [[familia POU|dominio POU]], como [[factor de transcrición octámero|Oct]]
*** 3.1.3 Familia: Dominio homeo con rexión LIM
*** 3.1.4 Familia: Dominio homeo e motivos dedo de cinc
** 3.2 Clase: Caixa apareada (''paired box'')
*** 3.2.1 Familia: Apareada (''paired'') e dominio homeo
*** 3.2.2 Familia: Dominio apareado só
** 3.3 Clase: [[proteínas FOX|''Fork head'']] / [[factor de transcrición hélice alada|hélice alada]]
*** 3.3.1 Familia: Reguladores de desenvolvemento, como ''[[forkhead]]''
*** 3.3.2 Familia: Reguladores específicos de tecidos
*** 3.3.3 Familia: Factores que controlan o ciclo celular
*** 3.3.0 Familia: Outros reguladores
** 3.4 Clase: [[factor de choque térmico|Factores de choque térmico]]
*** 3.4.1 Familia: HSF
** 3.5 Clase: Cústeres de triptófano
*** 3.5.1 Familia: Myb
*** 3.5.2 Familia: Ets-type
*** 3.5.3 Familia: [[factor regulatorio do interferón|factores regulatorios do interferón]]
** 3.6 Clase: Dominio TEA (factor de amplificador transcricional)
*** 3.6.1 Familia: TEA ([[TEAD1]], [[TEAD2]], [[TEAD3]], [[TEAD4]])
 
* 4 Superclase: Factores de armazón beta con contactos no suco menor
** 4.1 Clase: RHR ([[dominio de homoloxía Rel|rexión de homoloxía Rel]])
*** 4.1.1 Familia: Rel/[[repetición de anquirina|anquirina]]; [[NF-κB|NF-kappaB]]
*** 4.1.2 Familia: [[anquirina]] só
*** 4.1.3 Familía: [[NFAT]] ('''N'''uclear '''F'''actor of '''A'''ctivated '''T'''-cells, ou factores nucleares de células T activadas), como [[NFATC1]], [[NFATC2]], [[NFATC3]])
** 4.2 Clase: STAT
*** 4.2.1 Familia: [[proteína STAT|STAT]]
** 4.3 Clase: p53
*** 4.3.1 Familia: [[p53]]
** 4.4 Clase: [[MADS-box|caixa MADS]]
*** 4.4.1 Familia: Reguladores de diferenciación, como ([[Mef2]])
*** 4.4.2 Familia: Respondedores de sinais externos, SRF ([[factor de resposta sérico]])
*** 4.4.3 Familia: Reguladores metabólicos (ARG80)
** 4.5 Clase: Factores de transcrición [[barril beta]] [[hélice alfa]]
** 4.6 Class: [[proteína de unión á TATA|proteínas de unión á TATA]]
*** 4.6.1 Familia: proteínas de unión á tata (TBP)
** 4.7 Clase: [[HMG-box]]
*** 4.7.1 Familia: [[xenes SOX]], [[SRY]]
*** 4.7.2 Familia: TCF-1 ([[HNF1A|TCF1]])
*** 4.7.3 Familia: relacionados con HMG2, [[proteína de recoñecemento 1 específica de estrutura|SSRP1]]
*** 4.7.5 Familia: MATA
** 4.8 Clase: Factores heteroméricos [[caixa CCAAT|CCAAT]]
*** 4.8.1 Familia: Factores heteroméricos CCAAT
** 4.9 Clase: Grainyhead
*** 4.9.1 Familia: Grainyhead
** 4.10 Clase: Factores con [[dominio choque frío]] (''Cold-shock domain'')
*** 4.10.1 Familia: csd
** 4.11 Clase: Runt
*** 4.11.1 Familia: Runt
 
* 0 Superclase: Outros factores de transcrición
** 0.1 Clase: Proteínas puño de cobre
** 0.2 Clase: HMGI(Y) ([[HMGA1]])
*** 0.2.1 Familia: HMGI(Y)
** 0.3 Clase: Dominio peto (''pocket'')
** 0.4 Clase: factores tipo E1A
** 0.5 Clase: Factores AP2/relacionados con EREBP
*** 0.5.1 Familia: [[Apetala 2|AP2]]
*** 0.5.2 Familia: EREBP
*** 0.5.3 Superfamilia: [[dominio de unión ao ADN B3|AP2/B3]]
**** 0.5.3.1 Familia: ARF
**** 0.5.3.2 Familia: ABI
**** 0.5.3.3 Familia: RAV
 
== Notas ==
{{listaref|2}}
 
== Véxase tamén ==
=== Outros artigos ===
* [[Proteína de unión ao ADN]]
* [[Inhibidor das proteínas de unión ao ADN]]
* [[Receptor nuclear]], un tipo de ligando que que activa factores de transcrición
 
=== Ligazóns externas ===
* MeshName - Transcription+Factors [http://www.nlm.nih.gov/cgi/mesh/2011/MB_cgi?mode=&term=Transcription+Factors]
* [http://generegulation.info/index.php?option=com_content&view=article&id=47&Itemid=64 Protein-DNA binding: data, tools & models ]
* {{cite web | url = http://transcriptionfactor.org/ | title = DBD: Transcription factor database Home | accessdate = 2008-03-02 | author = | authorlink = | coauthors = | date = | work = | publisher = | pages = | archiveurl = | archivedate = }}<ref name="pmid18073188">{{cite journal | author = Wilson D, Charoensawan V, Kummerfeld SK, Teichmann SA |title = DBD––taxonomically broad transcription factor predictions: new content and functionality | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 36 | issue = Database issue | pages = D88–92 | year = 2008 | pmid = 18073188 | pmc = 2238844 |doi = 10.1093/nar/gkm964 }}</ref>
* {{cite web | url = http://8e.devbio.com/article.php?ch=5&id=39 | title = Transcription factors: DevBio on-line supplementary material to ''Developmental Biology'' | accessdate = 2008-03-02 | author = Gilbert FS | authorlink = | coauthors = | date = | work = | publisher = Sinauer Associates| pages = | archiveurl = | archivedate = }}<ref name="isbn0-87893-250-X">{{citeCita booklibro | author = Singer, Susan R.; Gilbert, Scott F. | title = Developmental Biology | publisher = Sinauer Associates | location = Sunderland, Mass | year = 2006 | pages =| isbn = 0-87893-250-X | oclc = | doi = }}</ref>
* {{cite web | url = http://www.gene-regulation.com/pub/databases/transfac/cl.html | title = Transcription Factor Classification, A classification of transcription factors based on their DNA-binding domains | accessdate = 2008-03-02 | author = | authorlink = | coauthors = | date = 2002-10-01 | work = | publisher = BIOBASE GmbH | pages = | archiveurl = | archivedate = }}<ref name="pmid16381825">{{cite journal | author = Matys V, Kel-Margoulis OV, Fricke E, Liebich I, Land S, Barre-Dirrie A, Reuter I, Chekmenev D, Krull M, Hornischer K, Voss N, Stegmaier P, Lewicki-Potapov B, Saxel H, Kel AE, Wingender E | title = TRANSFAC and its module TRANSCompel: transcriptional gene regulation in eukaryotes | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 34 | issue = Database issue | pages = D108–10 | year = 2006 | month = January | pmid = 16381825 | pmc = 1347505 | doi = 10.1093/nar/gkj143 | url = }}</ref>
* {{cite web | url = http://www.accessexcellence.org/RC/VL/GG/ecb/ecb_images/08_10_transcription_factors.jpg | title = Image of transcription factor function in humans | accessdate = 2008-03-02 | author = | authorlink = | coauthors = | date = | work = | publisher = Access Excellence, The National Health Museum| pages = | archiveurl = | archivedate = }} Figure 8-10 from ''Essential cell biology''.<ref name="isbn0-8153-3480-X">{{citeCita booklibro | author = Bruce Alberts, Dennis Bray, Karen Hopkin, Alexander Johnson, Julian Lewis, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter| title = Essential cell biology | publisher = Garland Science | location = New York | year = 2004 | pages = 896 pages | isbn = 0-8153-3480-X| oclc = |doi = }}</ref>
 
{{listaref}}