UTR: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
retiro ligazóns agora proporcionadas polo Wikidata
m Bot - Trocar {{AP}} por {{Artigo principal}}; cambios estética
Liña 3:
As UTR teñen grande importancia na [[regulación da expresión xénica]]. Por exemplo, existen proteínas adaptadoras que recoñecen secuencias específicas, non codificantes, da 3' UTR.<ref name="watson">{{cita libro| apellidos = Watson| nombre = J, D.| coautores = Baker, T. A.; Bell, S. P.; Gann, A.; Levine, M. et Losick, R | título = Molecular Biology of the Gene | edición = Fifth edition | año = 2004 | editorial = Benjamin Cummings | ubicación = San Francisco | id = ISBN 0-321-22368-3}}</ref> Ademais, están implicadas na correcta expresión espacial e temporal dos xenes.
 
As UTR aparecen tanto en [[xenoma]]s de [[Célula eucariota|eucariotaeucariotas]]s coma de [[procariota]]s e mesmo de [[virus]], malia a sinxeleza do xenoma destes últimos.<ref name="cann">{{cita libro| apellidos = Cann| nombre = Alan J.| título = Principles of Molecular Virology| edición = 4 | ano = 2005 | editorial = Elsevier | ubicación = Burlington, USA | id = ISBN 0-12-088787-8}}</ref>
 
== 5' UTR ==
{{APArtigo principal|Rexión non traducida cinco prima}}
A 5' UTR é unha rexión non traducida do [[extremo 5']] do ARNm, que comeza no sitio de comezo da transcrición e acaba cando se chega ao [[codón de iniciación]] da tradución, xa na rexión codificante. Esta rexión do ARNm contén elementos que controlan a expresión xénica por medio de elementos regulatorios. Nos [[procariota]]s a 5' UTR do ARNm xeralmente contén o sitio de unión ao ribosoma (RBS), tamén chamado [[secuencia Shine-Dalgarno]] (AGGAGGU).
 
A lonxitude media da 5' UTR é de ~150 nucleótidos en eucariotas (en humanos 170), pero pode chegar a ter miles de bases. Algúns virus e xenes celulares teñen 5' UTR inusualmente longos e estruturados, o que pode afectar á expresión xénica. Como media a 5' UTR é a metade de longa ca a 3' UTR. <ref>{{cita libro | título = Molecular Cell Biology | edición = 5th | autor = Lodish, ''et al.'' | chapter = chapter 4.2 | páxinas = 113}}</ref>. Nos procariotas as 5' UTR dos ARNm son máis curtas.
Liña 19:
* Intróns (dentro da 5' UTR) relacionados coa regulación da expresión xénica e a exportación do ARNm<ref>{{cite journal | author = Cenik, C, ''et al.'' | title = Genome analysis reveals interplay between 5' UTR introns and nuclear mRNA export for secretory and mitochondrial genes. |journal =PLoS Genetics| volume=7| issue=4| year=2011| doi=10.1371/journal.pgen.1001366 |url=http://www.plosgenetics.org/article/info:doi/10.1371/journal.pgen.1001366}}</ref>.
 
== 3' UTR ==
{{APArtigo principal|Rexión non traducida tres prima}}
A rexión 3' é unha rexión non traducida do [[extremo 3']] do ARNm, que comeza a partir do final da rexión codificante do ARNm. A lonxitude da rexión 3' UTR ten unha variación considerable nos ARNm de mamíferos (vai desde 60-80 ata 4000 [[nucleótido]]s, no home uns 700-800). Isto suxire que o [[xenoma humano]] evolucionou para incrementar o uso de mecanismos de control postranscricional na [[expresión xénica|expresión de xenes]]. Identificáronse 2772 secuencias curtas de nucleótidos na 3´ UTR, onde se unen os elementos reguladores do ARNm.
 
En moitos ARNm comprobouse que as rexións 3´ UTR están implicadas na regulación da estabilidade, localización e tradución dos mesmos. As rexións 3´ UTR gobernan a expresión dos xenes grazas á interacción entre os compoñentes estruturais do [[ARNm]] ([[elemento regulador en cis|elementos en cis]]) e factores específicos que [[actuación en trans|actúan en trans]] (proteínas que se unen a ARN e [[ARN non codificante]]s).
Liña 29:
O ARNm está regulado por tres procesos que se levan a cabo a través das rexións 3´ UTR, por medio da unión nelas de factores reguladores e da estrutura que poden formar:
 
* Transporte / localización
* Degradación / estabilidade
* [[Tradución (proteínas)|Tradución]].
Liña 42:
Na rexión 3' UTR dun ARNm atopamos varias secuencias reguladoras<ref>{{cite journal |author=Mazumder B, Seshadri V, Fox PL |title=Translational control by the 3'-UTR: the ends specify the means |journal=Trends Biochem. Sci. |volume=28 |issue=2 |pages=91–8 |year=2003 |pmid=12575997 |doi=10.1016/S0968-0004(03)00002-1}}</ref>:
* Un sinal de [[poliadenilación]], xeralmente ''AAUAAA'' ou unha variante. Marca o sitio de escisión do transcrito situado aproximadamente 30 bases despois do sinal. Despois de escindido engádeselle alí a [[cola poli-A]].
* Sitios de unión de proteínas, que poden afectar á estabilidade ou lugar de destino na célula do ARN, como os [[elemento SECIS|elementos SECIS]] (que fan que o ribosoma traduza o codón de stop UGA como [[selenocisteína]]), ou os [[elemento rico en AU|elementos ricos en AU]] (ARE), tramos que conteñen principalmente nucleótidos de [[adenina]] e [[uracilo]] cun núcleo básico da secuencia formado por AUUUA e UAUUUAU (que poden estabilizar ou desestabilizar o ARNm dependendo da proteína que se una a el).
* Sitios de unión para os [[microARN]].
 
Liña 50:
== Relación das rexións UTR con diferentes enfermidades ==
Existen diferentes alteracións que se producen nas rexións UTR 5´ ou 3´, que dan como resultado o desenvolvemento dunha determinada enfermidade<ref>{{cite journal |author=Pickering BM, Willis AE |title=The implications of structured 5' untranslated regions on translation and disease |journal=Semin. Cell Dev. Biol. |volume=16 |issue=1 |pages=39–47 |year=2005 |month=February |pmid=15659338 |doi=10.1016/j.semcdb.2004.11.006}}</ref>.
As alteracións nas secuencias UTR poden estar, por exemplo, implicadas no [[cancro|cáncer]]. Comprobouse que mutacións nas secuencias 3´ UTR reguladoras producen niveis anormais de ARNm, e desorde na localización e posterior tradución do mesmo por modificación dos factores que actúan en trans sobre eles, podendo desta maneira producir o fenotipo tumoral nas células.
Existen proteínas que se unen ás secuencias ARE das rexións 3´ UTR que poden ter un efecto positivo ou negativo sobre o ARNm á hora de transformar unha célula normal nunha tumoral.
Por exemplo, o xene da ciclina D1, que actúa na regulación do [[ciclo celular]], vese afectado por unha alteración en 3´ UTR, a cal causa que o ARNm sexa máis estable e se traduza sempre, contribuíndo ao desenvolvemento do tumor.
 
== Notas ==
{{listaref}}
== Véxase tamén ==
=== Bibliografía ===
* Griffiths, J .F. A. et al. (2002). Genética. McGraw-Hill Interamericana. ISBN 84-486-0368-0.
Liña 68:
* Identification of candidate regulatory sequences in mammalian 3´ UTR by statistical análisis of oligonucleotide distributions. Davide Corà, Ferdinando Di Conto, Michele Caselle anda Paolo Provero. BMC Bioinformatics (2007), 8: 174
* Over-Represented sequences located on 3´ UTR are potentially envolved in regulatory functions. Kihoon Yoon, Daijin Ko, Mark Doderer, Carolina B. Livi and Luiz O. F. Penalva. RNA Biol. (2008), 5(4): 255-262
* Role of 5´ and 3´ untranslated regions of mRNAs in human diseases. Sangeeta Chatterjee and Jayanta K. Pal. Biol. Cell (2009), 101: 251-262
* Role of the 3´ untranslated region in the regulation of cytosolic glutathione peroxidase and phospholipid-hydroperoxidase glutathione peroxidase gene expresión by selenium supply . Giovanna Bermano, John R. Arthur and John E. Hesketh. Biochem. J (1996), 320: 891-895
* Estructure and function of a cap-independent translation element that functions in either the 3´ or the 5´ untranslated region. L GUO, E. Allen and W. A. Miller. RNA (2000), 6: 1808-1820
 
===Ligazóns externas===
*[http://transterm.otago.ac.nz/RNAMotif.html Breve introdución aos elementos regulatorios do ARNm.]
*[http://www.ba.itb.cnr.it/UTR/ UTResource] Análises de 3' UTR.
*[http://www.utrome.org UTRome.org] As 3' UTR en nematodos.
*Medical Subject Heading: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=mesh&list_uids=68020413&dopt=Full 3' Untranslated Regions]
 
=== Ligazóns externas ===
* [http://transterm.otago.ac.nz/RNAMotif.html Breve introdución aos elementos regulatorios do ARNm.]
* [http://www.ba.itb.cnr.it/UTR/ UTResource] Análises de 3' UTR.
* [http://www.utrome.org UTRome.org] As 3' UTR en nematodos.
* Medical Subject Heading: [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=mesh&list_uids=68020413&dopt=Full 3' Untranslated Regions]
 
[[Categoría:ARN]]
[[Categoría: Xenética]]