==Estimación de HDLs por medio do colesterol asociado==
Os laboratorios clínicos antes medían o colesterol HDL separando as outras fracción lipídicas por ultracentrifugación ou precipitación química con ións divalentes como Mg<sup>2+</sup>, despois acoplando despois os produtos dunha reacción feita cunha colesterol oxidase a unha reacción indicadora. O método de referencia aínda usa unha combinación destas técnicas.<ref>{{cite web|title=National Reference System for Cholesterol - Cholesterol Reference Method Laboratory Network - HDL Cholesterol Certification Protocol for Manufacturers|url=http://www.cdc.gov/labstandards/pdf/crmln/MFRHDLNov2002final.pdf|publisher=CDC|accessdate=10 November 2013}}</ref> Agora, a maioría dos laboratorios usan métodos analíticos homoxéneos automatizados nos cales as lipoproteínas que conteñen [[Apolipoproteína B|apo B]] son bloqueadas usando [[anticorpo]]s para apo B, despois unha reacción encimática [[Colorimetría (método químico)|colorimétrica]] mide o colesterol nas partículas HDL non bloqueadas.<ref>{{cite journal | author = Warnick GR, Nauck M, Rifai N | title = Evolution of Methods for Measurement of HDL-Cholesterol: From Ultracentrifugation to Homogeneous Assays | journal = Clinical Chemistry | volume = 47 | issue = 9 | pages = 1579–1596 | date = September 2001 | pmid = 11514391 | url = http://www.clinchem.org/content/47/9/1579.full | accessdate = 10 November 2013 }}</ref> [[High-performanceTamén liquidse chromatography|HPLC]]pode canusar alsoa becromatografía usedlíquida de alto rendemento ([[HPLC]]).<ref>{{cite journal | author = Okazaki M, Sasamoto K, Muramatsu T, Hosaki S | title = Evaluation of precipitation and direct methods for HDL-cholesterol assay by HPLC | journal = Clinical Chemistry | volume = 43 | issue = 10 | pages = 1885–90 | year = 1997 | pmid = 9342008 | url = http://www.clinchem.org/cgi/content/abstract/43/10/1885 }}</ref> As subfraccións (HDL-2C, HDL-3C) poden tamén medirse<ref>{{cite journal | author = Hirano T, Nohtomi K, Koba S, Muroi A, Ito Y | title = A simple and precise method for measuring HDL-cholesterol subfractions by a single precipitation followed by homogenous HDL-cholesterol assay | journal = The Journal of Lipid Research | volume = 49 | issue = 5 | pages = 1130–6 | year = 2008 | pmid = 18223297 | doi = 10.1194/jlr.D700027-JLR200 }}</ref> e teñen importancia clínica. A mdedidamedida da capacidade reactiva da apo-A pode utilizarse para medir o colesterol HDL, mais pénsase que é menos exacta.
