Elemento rico en AU: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
traducido de en:AU-rich element.
(Sen diferenzas.)

Revisión como estaba o 2 de agosto de 2013 ás 19:33

Os elementos ricos en adenilato-uridilato ou elementos ricos en AU (AREs) son secuencias de ARN que se encontran nas rexións 3' UTR de moitos ARN mensaxeiros que codifican protooncoxenes, factores de transcrición nuclear, e citocinas. Os elementos ricos en AU son un dos determinantes máis comúns da estabilidade do ARN en células de mamíferos.[1]

Os elementos ricos en AU ou AREs defínense como unha rexión con abundancia das bases adenina e uridina nun ARNm. Xeralmente marcan o ADN para a degradación.[2][3] A degradación do ARN dirixida polos AREs está influenciada por moitos factores exóxenos, como a presenza de ésteres forbol, ionóforos de calcio, citocinas, e inhibidores da transcrición.[4] Estas observacións suxiren que os elementos ricos en AU xogan un papel crítico na regulación da transcrición xénica durante o crecemento celular e diferenciación, e a resposta inmune.[5]

Os elementos ricos en AU divídense en tres clases con diferentes secuencias. A mellor caracterizada é a dos elementos ricos en AU que teñen unha secuencia central de AUUUA dentro de secuencias ricas en U (por exemplo WWWU(AUUUA)UUUW, onde W é A ou U). Isto encóntrase dentro dunha secuencia de 50-150 bases, e a miúdo se requiren repeticións da secuencia central AUUUA para que funcionen.

A number of different proteins (e.g. HuA, HuB, HuC, HuD, HuR) bind to these elements and stabilise the mRNA while others (AUF1, TTP, BRF1, TIA-1, TIAR, and KSRP) destabilise the mRNA, miRNAs may also bind to some of them.[6] HuD (also calledELAVL4) binds to AREs and increases the half-life of ARE-bearing mRNAs in neurons during brain development and plasticity.[7]

AREsite - a database for ARE containing genes - has recently been developed with the aim to provide detailed bioinformatic characterization of AU-rich elements.[8]

Notas

  1. Chen, Chyi-Ying A.; Shyu, Ann-Bin (1995). "AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation". Trends In Biochemical Science 20 (11): 465–470. PMID 8578590. doi:10.1016/S0968-0004(00)89102-1.  Parámetro descoñecido |month= ignorado (Axuda); A referencia usa o parámetro obsoleto |coauthors= (Axuda)
  2. C Barreau, L Paillard and H B Osborne (2006). "AU-rich elements and associated factors: are there unifying principles?". Nucleic Acids Res 33 (22): 7138–7150. PMC 1325018. PMID 16391004. doi:10.1093/nar/gki1012. 
  3. Shaw G, Kamen R (1986). "A conserved AU sequence from the 3' untranslated region of GM-CSF mRNA mediates selective mRNA degradation". Cell 46 (5): 659–67. PMID 3488815. doi:10.1016/0092-8674(86)90341-7.  Parámetro descoñecido |month= ignorado (Axuda)
  4. Chen, Chyi-Ying A.; Shyu, Ann-Bin (1995). "AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation". Trends In Biochemical Science 20 (11): 465–470. PMID 8578590. doi:10.1016/S0968-0004(00)89102-1.  Parámetro descoñecido |month= ignorado (Axuda); A referencia usa o parámetro obsoleto |coauthors= (Axuda)
  5. Chen, Chyi-Ying A.; Shyu, Ann-Bin (1995). "AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation". Trends In Biochemical Science 20 (11): 465–470. PMID 8578590. doi:10.1016/S0968-0004(00)89102-1.  Parámetro descoñecido |month= ignorado (Axuda); A referencia usa o parámetro obsoleto |coauthors= (Axuda)
  6. Federico Bolognani and Nora Perrone-Bizzozero (2008). "RNA-protein interactions and control of mRNA stability in neurons". J Neurosci Res 86 (3): 481–489. PMID 17853436. doi:10.1002/jnr.21473. 
  7. Nora Perrone-Bizzozero and Federico Bolognani (2002). "Role of HuD and other RNA-binding proteins in neural development and plasticity". J Neurosci Res 68 (2): 121–126. PMID 11948657. doi:10.1002/jnr.10175. 
  8. Gruber AR, Fallmann J, Kratochvill F, Kovarik P, Hofacker IL (2011). "AREsite: a database for the comprehensive investigation of AU-rich elements". Nucleic Acids Res 39 (Database issue): D66–9. PMC 3013810. PMID 21071424. doi:10.1093/nar/gkq990. 

Véxase tamén

Ligazóns externas