A mediados do [[século VI]] produciuse unha [[pandemia]] coñecida como [[Peste de Xustiniano]], que matou a unha terceira parte dos habitantes do [[Imperio Bizantino]], que se cre foi debida aá peste bubónica. Houbo epidemias recorrentes e non desapareceu de todo ata o ano 750. <ref>{{cite web |title=Europe’s Plagues Came From China, Study Finds |url=http://www.nytimes.com/2010/11/01/health/01plague.html |work=[[The New York Times]] |date=October 31, 2010 |accessdate=2010-11-01 }}</ref> Un estudo xenético suxire que esta praga se orixinou de cepas hoxe extintas de ''Y. pestis'', xeneticamente distintas dadas cepas que orixinaron a [[pestePeste negra]] no século XIV, ou talvez de patóxenos non relacionados coa peste bubónica.<ref>{{cite news|last=McGrath|first=Matt|title=Black Death Genetic Code 'Built' |publisher=[[BBC World Service]]|url=http://www.bbc.co.uk/news/health-15278366 |accessdate=12 October 2011|date=12 October 2011}}</ref><ref>{{cite journal|url=http://www.nature.com/nature/journal/v478/n7370/full/nature10549.html|title=A draft genome of Yersinia pestis from victims of the Black Death|last1=Bos|first1=Kirsten|journal=Nature|volume=478|issue=7370|pages=506–510|doi=10.1038/nature10549|date=12 October 2011|bibcode = 2011Natur.478..506B }}</ref> En 2012 investigadores alemáns recolleron mostras de ''Y. pestis'' de tumbas da época de Xustiniano para reconstruir o ADN da bacteria.<ref>{{cite web |url=http://www.plospathogens.org/article/info:doi/10.1371/journal.ppat.1003349 |title=Yersinia pestis DNA from Skeletal Remains from the 6th Century AD Reveals Insights into Justinianic Plague |date=2013-05-02 |accessdate=2013-05-16 |publisher=PLOS Pathogens |author= multiple}}</ref>
