Diferenzas entre revisións de «Virus de ARN»

As clasificacións propostas para os virus de ARN de cadea positiva baseadas no estudo do xene da ARN polimerase ARN-dependente establecen tres grupos:<ref name=Koonin>{{cite journal | author = Koonin EV | year = 1991 | title = The phylogeny of RNA-dependent RNA polymerases of positive-strand RNA viruses | url = | journal = J Gen Virol | volume = 72 | issue = 9| pages = 2197–206 }}</ref>
 
I. O grupo de tipo picorna ou Picornavirata, formado por: bymovirusbimovirus, comovirus, nepovirus, nodavirus, picornavirus, potyviruspotivirus, sobemovirus e un subconxunto de luteovirus (virus do amarelado da remolacha occidental e virus do enrolamento da folla da pataca).
 
II. O grupo de tipo flavi ou Flavivirata, que comprende: carmovirus, dianthovirus, flavivirus, pestivirus, tombusvirus, [[bacteriófago]]s de ARN monocatenarios, virus da hepatite C e un subconxunto de luteovirus (virus do anannismo amarelo da cebada).
 
III. O grupo de tipo alfa ou Rubivirata, que inclúe a: alphavirusalfavirus, carlavirus, furovirus, hordeivirus, potexvirus, rubivirus, tobravirus, tricornavirus, tymovirustimovirus, virus da mancha foliar clorótica da mazá, virus do amarelado da remolacha e virus da hapatite E.
 
Propúxose unha división do supergrupo de tipo alfa (os de tipo Sindbis) baseándose no estudo dun novo dominio localizado preto do extremo [[N-terminal]] de proteínas implicadas na replicación viral.<ref name=Rozanov1992>Rozanov MN, Koonin EV, Gorbalenya AE (1992) Conservation of the putative methyltransferase domain: a hallmark of the 'Sindbis-like' supergroup of positive-strand RNA viruses. J Gen Virol 73 (8):2129-2134</ref> Os dous grupos propostos son: o grupo dos "altovirus" (alphavirus, furovirus, virus da hepatite E, hordeivirus, tobamovirus, tobravirus, tricornavirus e probablemente rubivirus); e o grupo dos "tipovirus" (virus da mancha foliar clorótica da mazá, carlavirus, potexvirus e tymovirustimovirus).
 
O supergrupo alfa pode ser ademais dividido en tres clados: o de tipo rubi, de tipo tobamo e de tipo tymotimo.<ref name=Koonin1993>Koonin, EV, Dolja VV (1993) Evolution and taxonomy of positive-strand RNA viruses: implications of comparative analysis of amino acid sequences. Crit Rev Biochem Mol Biol 28:375-430</ref>
 
Traballos adicionais identificaron cinco grupos de virus de ARN de fibra positiva que conteñen, respectivamente, catro, tres, tres, thres e unha orde(s).<ref name=Ward1993>{{cite journal | author = Ward CW | year = 1993 | title = Progress towards a higher taxonomy of viruses | url = | journal = Res Virol | volume = 144 | issue = 6| pages = 419–453 }}</ref> Estas catorce ordes conteñen 31 familias de virus (incluíndo 17 familias de virus de plantas) e 48 xéneros (incluíndo 30 xéneros de virus de plantas). Esta análise suxire que os alphavirus e flavivirus poden separarse en dúas familias, os Togaviridae e os Flaviridae, pero suxire que outras asignacións taxonómicas poden ser incorrectas, como as dos pestivirus, virus da hepatite C, rubivirus, virus da hepatite E e arterivirus. Os coronavirus e torovirus parecen ser familias distintas de distintas ordes e non distintos xéneros da mesma familia como son clasificados actualmente. Os luteovirus parecen ser dúas familias e non unha e o virus da mancha foliar clorótica da mazá parece que non é un closterovirus senón un novo xénero de Potexviridae.
; Evolución
 
A evolución dos picornavirus baseada na análise das súas ARN polimerases e [[helicase]]s parece datar a diverxencia dos [[Eukarya|eucariota]]s.<ref name=Koonin2008>Koonin EV, Wolf YI, Nagasaki K, Dolja VV (2008) The Big Bang of picorna-like virus evolution antedates the radiation of eukaryotic supergroups. Nat Rev Microbiol 6(12):925-939</ref> Os seus supostos antepasados poderían ser os [[retroelemento]]s de grupo II bacterianos, a familia de [[protease]]s HtrA e os bacteriófagos de ADN.
 
===Virus de ARN bicatenario===
190.202

edicións