Sintenia: Diferenzas entre revisións
Contido eliminado Contido engadido
Nova páxina: "{{entradución}} A '''sintenia''' (do grego σύν, ''syn'', ao longo + ταινία, ''tainiā'', banda, fita) In classical genetics, '''synteny''' describes the physical c..." |
Sen resumo de edición |
||
Liña 1:
{{entradución}}
A '''sintenia''' (do grego σύν, ''syn'', ao longo + ταινία, ''tainiā'', banda, fita) é a presenza simultánea no mesmo [[cromosoma]] de dous ou máis [[loci]] xenéticos nun individuo ou especie, independentemente do seu [[ligamento xenético]]. A noción de sintenia úsase moito para describir a conservación da orde dos [[xene]]s entre dúas especies emparentadas.
Sintenia e ligamento xenético son conceptos relacionados pero diferentes. O ligamento entre dous loci establécese normalmente pola observación de frecuencias de [[recombinación xenética]] entre eles menores do esperado. Os loci que están nun mesmo cromosoma son por definición sinténicos, aínda que ás veces as súas frecuencias de recombinación non se poden distinguir das dos xenes non ligados. Por tanto, en teoría, todos os loci ligados son sinténicos, pero non todos os loci sinténicos están necesariamente ligados.
As especies que se separaron evolutivamente hai relativamente pouco tempo presentan bloques de xenes situados nos seus [[xenoma]]s en posicións relativas iguais. Por exemplo, moitos dos xenes humanos son sinténicos cos doutros mamíferos. O estudo da sintenia pode servir para coñecer os rearranxos que sufriu o xenoma ao longo da evolución. <ref>http://www.britannica.com/EBchecked/topic/262934/heredity/262018/Synteny?anchor=ref944552</ref>:
== Shared synteny ==
A análise da sintenia no sentido de orde dos xenes ten moitas aplicacións en [[xenómica]]. A sintenia compartida é un dos criterios máis fiables para establecer a [[ortoloxía]] de rexións xenómicos en diferentes especies. A conservación excepcional da sintenia en certos xenes pode indicar que eses xenes teñen importantes relacións funcionais e deben estar xuntos, por exemplo no casp do clúster de xenes "[[Homeobox]]", que determinan o plan de organización do animal e que está moi conservado. Os patróns da sintenia compartida ou as roturas da sintenia poden utilizarse para inferir [[filoxenia]]s e mesmo para deducir a organización xenómica de especies extintas ancestrais. Xeralmente faise unha distinción cualitativa entre '''macrosintenia''' (preservación da sintenia en grandes porcións do cromosoma) e '''microsintenia''' (preservación da sintenia en só uns poucos xenes á vez).
▲The term is sometimes also used to describe preservation of the precise order of genes on a chromosome passed down from a common ancestor,<ref>{{cite journal |author=Engström PG, Ho Sui SJ, Drivenes O, Becker TS, Lenhard B |title=Genomic regulatory blocks underlie extensive microsynteny conservation in insects |journal=Genome Res. |volume=17 |issue=12 |pages=1898–908 |year=2007 |pmid=17989259 |doi=10.1101/gr.6669607 |pmc=2099597}}</ref><ref name="pmid17989258">{{cite journal |author=Heger A, Ponting CP |title=Evolutionary rate analyses of orthologs and paralogs from 12 Drosophila genomes |journal=Genome Res. |volume=17 |issue=12 |pages=1837–49 |year=2007 |pmid=17989258 |doi=10.1101/gr.6249707 |pmc=2099592}}</ref><ref name="pmid17983469">{{cite journal |author=Poyatos JF, Hurst LD |title=The determinants of gene order conservation in yeasts |journal=Genome Biol |volume=8 |issue=11 |pages=R233 |year=2007 |pmid=17983469 |doi=10.1186/gb-2007-8-11-r233 |pmc=2258174}}</ref><ref name="pmid17434902">{{cite journal |author=Dawson DA, Akesson M, Burke T, Pemberton JM, Slate J, Hansson B |title=Gene order and recombination rate in homologous chromosome regions of the chicken and a passerine bird |journal=Mol. Biol. Evol. |volume=24 |issue=7 |pages=1537–52 |year=2007 |pmid=17434902 |doi=10.1093/molbev/msm071}}</ref> although many geneticists reject this use of the term.<ref>{{cite journal | author=Passarge, E., B. Horsthemke & R. A. Farber|year=1999|title=Incorrect use of the term synteny|journal=Nature Genetics|volume=23 | issue=4|pages=387|doi=10.1038/70486}}</ref> The analysis of synteny in the gene order sense has several applications in genomics. Shared synteny is one of the most reliable criteria for establishing the [[orthology]] of genomic regions in different species. Additionally, exceptional conservation of synteny can reflect important functional relationships between genes. For example, the order of genes in the "[[Homeobox|Hox cluster]]", which are key determinants of the [[animal]] [[body plan]] and which interact with each other in critical ways, is essentially preserved throughout the animal kingdom.{{Citation needed|date=January 2008}} Patterns of shared synteny or synteny breaks can also be used as [[Trait (biology)|characters]] to infer the [[phylogenetic]] relationships among several species, and even to infer the genome organization of extinct ancestral species. A qualitative distinction is sometimes drawn between '''macrosynteny''', preservation of synteny in large portions of a chromosome, and '''microsynteny''', preservation of synteny for only a few genes at a time.
==
{{listaref}}
==Véxase tamén==
===Outros artigos===
* [[Elemento ultraconservado]]
* [[Xenoma humano]]
===Ligazóns externas===
|