A calmodulina é unha proteína pequena, composta aproximadamente por 148 [[aminoácido]]s e cun peso molecular de 16.706 Da de secuencia moi conservada. Está formada por unha única cadea polipeptídica e presenta un [[dominio proteico|dominio globular]] [[N-terminal]] e un dominio globular [[C-terminal]] unidos entre si por unha [[hélicezona alfa]]de unión flexible. Cada uno destes dominios presenta dous lugares de unión ao calcio e están formados por unha conformación de 12 residuos aminoacídicos, rodeados por dúas hélices que poden adoptar diversos ángulos de apertura.
A proteína presenta dous dominios aproximadamente simétricos, separados por unha rexión en forma "de bisagra" moi flexible.
