Falando estritamente, os números EC non especifican encimas, senón máis ben reaccións catalizadas por encimas. Se distintos encimas (por exemplo de diferentes organismos) catalizan a mesma reacción, recibirán o mesmo número EC.<ref>{{cite web | publisher = ExPASy | title = ENZYME (Enzyme nomenclature database) | url = http://www.expasy.org/enzyme/ | accessdate = 2006-03-14
}}</ref> ByPolo contrastcontrario, existen tamén os identificadores [[UniProt]], identifiersque uniquelyespecifican specifyunha a[[proteína]] proteinsó bypola itssúa aminosecuencia acidde sequenceaminoácidos.<ref name="pmid14681372">{{cite journal | author = Apweiler R, Bairoch A, Wu CH, Barker WC, Boeckmann B, Ferro S, Gasteiger E, Huang H, Lopez R, Magrane M, Martin MJ, Natale DA, O'Donovan C, Redaschi N, Yeh LS | title = UniProt: the Universal Protein knowledgebase | journal = Nucleic Acids Res. | volume = 32 | issue = Database issue | pages = D115–9 | year = 2004 | month = January | pmid = 14681372 | pmc = 308865 | doi = 10.1093/nar/gkh131 | url = | issn = }}</ref>
