Marco aberto de lectura: Diferenzas entre revisións

Contido eliminado Contido engadido
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Miguelferig (conversa | contribucións)
Sen resumo de edición
Liña 2:
En [[xenética]] chámase '''marco aberto de lectura''', '''pauta aberta de lectura''' ou '''ORF''' (''Open reading frame'') a calquera secuencia de [[ADN]] comprendida entre un [[codón]] de inicio da tradución e un codón de terminación, que potencialmente podería servir para codificar unha [[proteína]]. Está limitado polas rexións non traducidas ou [[UTR]] (''Untranslated Regions'').
 
Os ORFs utilízanse para buscar [[xene]]s que codifican proteínas en secuencias de nucleótidos <ref name=deonier2005p25>[[#deonier2005|Deonier 2005]], p. 25</ref>. A procura de ORFs está facilitada polo uso de ferramentas bioinformáticas, que utilizan algoritmos que buscan os codóns de inicio ou parada. Cando se encontra un ORF é un bo indicio de que a secuencia pode ser un xene, do cal o ORF formará parte. O descubrimento dun codón de parada nunha secuencia non é por si só indicio de que hai alí un xene, xa que o codón de parada pode formarse por pura casualidade (nunha secuencia con igual cantidade de nucleótidos de cada clase é esperable que apareza un codón de parada de forma aleatoria unha vez cada 25 codóns). As ORF que conteñen xenes son xeralmente longas, duns 300-400 codóns, o que é suficiente para o tamaño típico dunha proteína. Se son moi curtas non soen ser xenes. É máis doado atopalas en [[procariota]]s ca en [[eucariota]]s, xa que estes últimos teñen [[intrón]]s intercalados non codificantes intercalados entre os [[exón]]s, e neles é mellor estudar a secuencia do [[ARNm]] maduro.
 
Hai que buscar unha secuencia que empece nun codón de inicio e forme unha sucesión de codóns e acabe nun codón de parada. Pero como a secuencia hai que lela de tres en tres [[nucleótido]]s (para formar os codóns) podemos empezar tomando como primeiro nucleótido calquera. Segundo por cal empecemos poden formarse ou non ORFs con codóns de parada, xa que os codóns formados serán distintos.